RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSFA2P28290 1259 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 NYXQ9GZU5 481 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 RTL9Q8NET4 1388 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNPATO15228 680 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 NTSR2O95665 410 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SDSP20132 328 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTSWP56202 376 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 CASC1Q6TDU7 716 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 PROM2Q8N271 834 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 RFC4P35249 363 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TXNRD1Q16881 649 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 POTEAQ6S8J7 498 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLAD1Q8NFF5 587 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SETDB2Q96T68 719 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 AKAP2Q9Y2D5 859 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 BTAF1O14981 1849 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEC24BO95487 1268 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC152Q4G0S7 254 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 LY75O60449 1722 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ITGA6P23229 1130 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCNQ4P56696 695 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TFCP2Q12800 502 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNNI3KQ59H18 835 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 AACSQ86V21 672 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL27Q8NEV9 243 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SBF2Q86WG5 1849 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 APBA3O96018 575 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5JP18859 108 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYNE4Q8N205 404 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TBC1D32Q96NH3 1257 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 SIL1Q9H173 461 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNTROBQ8N137 903 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 EVI5LQ96CN4 794 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 GREM2Q9H772 168 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIP1O00291 1037 aa11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TM4SF1P30408 202 aa11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 REC8O95072 547 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHMLP26374 656 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRRC24Q50LG9 513 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 NLRP3Q96P20 1036 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 C22orf23Q9BZE7 217 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUP98P52948 1817 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDE8BO95263 885 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 GYS1P13807 737 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERFEQ4G0M1 354 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 C4BP0C0L5 1744 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 HAUS7Q99871 368 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 USP26Q9BXU7 913 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms