RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HIP1O00291 1037 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SMTNL1A8MU46 457 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARID5BQ14865 1188 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BRF1Q92994 677 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A087WWV3 80 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HOXB7P09629 217 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 H3BQV1 296 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IFFO2Q5TF58 517 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC112Q8NEF3 446 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa17.02■□□□□ 0.32
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KSR2Q6VAB6 950 aa17.02■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KAZALD1Q96I82 304 aa17.02■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC2Q9BYS8 371 aa17.02■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EID1Q9Y6B2 187 aa17.02■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DIP2AQ14689 1571 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ALDH1L1O75891 902 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CHGBP05060 677 aa17.01■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRM8O00222 908 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXW7Q969H0 707 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP27XA6NNY8 438 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PPFIA3O75145 1194 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RESTQ13127 1097 aa17■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GTF3C6Q969F1 213 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CEP135Q66GS9 1140 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 Q6ZUG5 572 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 V9GYY5 206 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MED23Q9ULK4 1368 aa16.99■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TAF5LO75529 589 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FGD1P98174 961 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FEZ1Q99689 392 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC8AQ8IWT6 810 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NEK1Q96PY6 1258 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OGFRQ9NZT2 677 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP16Q9Y5T5 823 aa16.98■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IQCB1Q15051 598 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LINS1Q8NG48 757 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IP6K1Q92551 441 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNRKQ9NRH2 765 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.97■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 COL15A1P39059 1388 aa16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BECN2A8MW95 431 aa16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIF20AO95235 890 aa16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.96■□□□□ 0.31
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CFAP45Q9UL16 551 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SKILP12757 684 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SCRN1Q12765 414 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.95■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PTPN14Q15678 1187 aa16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MYL6BP14649 208 aa16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GUCY1B3Q02153 619 aa16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SYCP1Q15431 976 aa16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STX1AQ16623 288 aa16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCDC69A6NI79 296 aa16.93■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGKV5-2P06315 115 aa16.93■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KCNA6P17658 529 aa16.93■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDC25BP30305 580 aa16.93■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KRT32Q14532 448 aa16.93■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TBX22Q9Y458 520 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms