RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430525.5

TTC28-AS1-210, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 524 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FAM89AQ96GI7 184 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 VPS33BQ9H267 617 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 HYPKQ9NX55 129 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DUOX1Q9NRD9 1551 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CXCL9Q07325 125 aa18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MPNDQ8N594 471 aa18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SUPT20HQ8NEM7 779 aa18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 IFT57Q9NWB7 429 aa18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 VEGFBP49765 207 aa18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GNAI1P63096 354 aa18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC184Q52MB2 194 aa18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-210ENST00000430525 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TNS4Q8IZW8 715 aa18.7■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 YDJCA8MPS7 323 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RASSF10A6NK89 507 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RAD17O75943 681 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TMC4Q7Z404 712 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TRAF5O00463 557 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FOXN1O15353 648 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GOLGA2Q08379 1002 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CST9Q5W186 159 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TSPYL6Q8N831 410 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MYD88Q99836 296 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 POLLQ9UGP5 575 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SHTN1A0MZ66 631 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GPSM2P81274 684 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TNIP1Q15025 636 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RIMBP2O15034 1052 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CAPN15O75808 1086 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RPS8P62241 208 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WASHC4Q2M389 1173 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SEC31BQ9NQW1 1179 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SCN9AQ15858 1988 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WBP1LQ9NX94 342 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PGAP2Q9UHJ9 254 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 C6orf229H3BNL8 230 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MYH3P11055 1940 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SPEF2Q9C093 1822 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PSMD14O00487 310 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DOK7Q18PE1 504 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WWC1Q8IX03 1113 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MICALL2Q8IY33 904 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RTL9Q8NET4 1388 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ECE2O60344 883 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PDE8AO60658 829 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC27Q2M243 656 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 AIDAQ96BJ3 306 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CAPNS2Q96L46 248 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PSME4Q14997 1843 aa18.58■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-210ENST00000430525 H7C1D1 291 aa18.58■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-210ENST00000430525 IGKV5-2P06315 115 aa18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms