RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
HERC3-205ENST00000426683 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.9■■□□□ 1.26
HERC3-205ENST00000426683 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HERC3-205ENST00000426683 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.89■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.89■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.88■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 SNED1Q8TER0 1413 aa22.88■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 CASP7P55210 303 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 CTSWP56202 376 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 SBF1O95248 1867 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 ALDH1L1O75891 902 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 SP8Q8IXZ3 490 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 TMC4Q7Z404 712 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 PSMD1Q99460 953 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 GRM8O00222 908 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HERC3-205ENST00000426683 COL4A1P02462 1669 aa22.82■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 MPNDQ8N594 471 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 GREM2Q9H772 168 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 TAF1P21675 1872 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 KIF16BQ96L93 1317 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 RTL9Q8NET4 1388 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 BCAR3O75815 825 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 CSF1RP07333 972 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 GLTPD2A6NH11 291 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 FOXO4P98177 505 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 FAM161AQ3B820 660 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC3-205ENST00000426683 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 ITGA6P23229 1130 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 GPSM2P81274 684 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 JDP2Q8WYK2 163 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 UTYO14607 1347 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 PPIP5K2O43314 1243 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 AOC3Q16853 763 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 SUCLG2Q96I99 432 aa22.75■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 VPS33BQ9H267 617 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.74■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 MYH3P11055 1940 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 KIF3CO14782 793 aa22.73■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 COL4A5P29400 1685 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 C6orf229H3BNL8 230 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 FZD9O00144 591 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 NIM1KQ8IY84 436 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 KAZALD1Q96I82 304 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 USP44Q9H0E7 712 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 RRAGCQ9HB90 399 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 POLLQ9UGP5 575 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.72■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.71■■□□□ 1.23
HERC3-205ENST00000426683 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.7■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.7■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 TRIM27P14373 513 aa22.69■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HERC3-205ENST00000426683 WASHC4Q2M389 1173 aa22.69■■□□□ 1.22
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