RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.47■■□□□ 1.19
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.47■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.47■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC27A2O14975 620 aa22.46■■□□□ 1.19
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.46■■□□□ 1.19
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC24Q50LG9 513 aa22.45■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF20Q5VTR2 975 aa22.45■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PANK2Q9BZ23 570 aa22.45■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.44■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMA5P28066 241 aa22.43■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.43■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.43■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMM10P62072 90 aa22.42■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.42■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.42■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPT2Q8TD30 523 aa22.42■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.42■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.41■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.41■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.41■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.41■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.4■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM89AQ96GI7 184 aa22.4■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.4■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GUL7 405 aa22.4■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.4■■□□□ 1.18
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.4■■□□□ 1.18
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPEF2Q9C093 1822 aa22.39■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.39■■□□□ 1.17
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF445P59923 1031 aa22.38■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ME3Q16798 604 aa22.38■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.38■■□□□ 1.17
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYT1P21579 422 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRAPQ86VF7 1730 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS6KB1P23443 525 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST3GAL1Q11201 340 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TICAM2Q86XR7 235 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.37■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX6O43752 255 aa22.36■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.36■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NLRP10Q86W26 655 aa22.36■■□□□ 1.17
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBD3O95983 291 aa22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPTP24298 496 aa22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJB2P29033 226 aa22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT32Q14532 448 aa22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD1Q15327 319 aa22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYH3P11055 1940 aa22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYNE4Q8N205 404 aa22.34■■□□□ 1.17
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