RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFFO2Q5TF58 517 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF181Q9P0P0 153 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMB2P55268 1798 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF16BQ96L93 1317 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.01■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BBOX1O75936 387 aa22■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMNB1P20700 586 aa22■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTSWP56202 376 aa21.99■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OLFM4Q6UX06 510 aa21.99■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.98■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMC4Q7Z404 712 aa21.98■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.98■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNA1SQ13698 1873 aa21.98■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRM8O00222 908 aa21.97■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CASP7P55210 303 aa21.97■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.96■■□□□ 1.11
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SP8Q8IXZ3 490 aa21.95■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.95■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSMD1Q99460 953 aa21.95■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNED1Q8TER0 1413 aa21.95■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRELPP51888 382 aa21.94■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.94■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCAR3O75815 825 aa21.93■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTL9Q8NET4 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.93■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.92■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOMM70O94826 608 aa21.92■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC51AQ86UW1 340 aa21.92■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GREM2Q9H772 168 aa21.92■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.91■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPNDQ8N594 471 aa21.9■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.9■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UTYO14607 1347 aa21.89■■□□□ 1.1
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSF1RP07333 972 aa21.89■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM161AQ3B820 660 aa21.89■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.89■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.89■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SBF1O95248 1867 aa21.89■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITGA6P23229 1130 aa21.88■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXO4P98177 505 aa21.88■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.88■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.88■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM27P14373 513 aa21.87■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APLP1P51693 650 aa21.87■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.87■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL4A1P02462 1669 aa21.86■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.86■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SUCLG2Q96I99 432 aa21.86■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP44Q9H0E7 712 aa21.86■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JDP2Q8WYK2 163 aa21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS33BQ9H267 617 aa21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.85■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPIP5K2O43314 1243 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPSM2P81274 684 aa21.84■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYH3P11055 1940 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.83■■□□□ 1.09
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAF1P21675 1872 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLTPD2A6NH11 291 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AOC3Q16853 763 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KAZALD1Q96I82 304 aa21.82■■□□□ 1.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms