RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 EXOC5O00471 708 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q6ZUG5 572 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 JADE2Q9NQC1 790 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 F13A1P00488 732 aa16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TESK2Q96S53 571 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 STX8Q9UNK0 236 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP8B2P98198 1209 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 VAMP4O75379 141 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNX21Q969T3 373 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ALG1Q9BT22 464 aa16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 GRM8O00222 908 aa16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM107BQ9H098 131 aa16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 DTNBO60941 627 aa16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CPA1P15085 419 aa16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 AK2P54819 239 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM47Q96LD4 638 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZBTB43O43298 467 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CEP85Q6P2H3 762 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CTR9Q6PD62 1173 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CAVIN2O95810 425 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CUL7Q14999 1698 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANAPC15P60006 121 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 DRC1Q96MC2 740 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 AKR1B10O60218 316 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CETN2P41208 172 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CALML4Q96GE6 196 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 DCTPP1Q9H773 170 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTGS1P23219 599 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 WTAPQ15007 396 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZMYND15Q9H091 742 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 KAT14Q9H8E8 782 aa16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGSF3O75054 1194 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 MCM6Q14566 821 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 MCM3P25205 808 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 TYRO3Q06418 890 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 POTEJP0CG39 1038 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP2B3Q16720 1220 aa16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.39■□□□□ 0.22
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMC5Q8IY18 1101 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIF5BP33176 963 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 NGLY1Q96IV0 654 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 TNIP1Q15025 636 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 KSR2Q6VAB6 950 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 KCNG4Q8TDN1 519 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 MMRN2Q9H8L6 949 aa16.39■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 UBE4AQ14139 1066 aa16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDE4BQ07343 736 aa16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 WDR78Q5VTH9 848 aa16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 KANK3Q6NY19 840 aa16.38■□□□□ 0.21
RPS6KC1-201ENST00000366959 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms