RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 LNPKQ9C0E8 428 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CSF1RP07333 972 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 RGS3P49796 1198 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 FAM161AQ3B820 660 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 SERPINB2P05120 415 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 SIL1Q9H173 461 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 DDR1Q08345 913 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 ABCC12Q96J65 1359 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CNBD1Q8NA66 436 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CASZ1Q86V15 1759 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 RAB11FIP3O75154 756 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 MMP10P09238 476 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 COPRSQ9NQ92 184 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 GREM2Q9H772 168 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 ITGA6P23229 1130 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 KIF1BPQ96EK5 621 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 PDE4AP27815 886 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 ST5P78524 1137 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 RHPN1Q8TCX5 695 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 NLRP3Q96P20 1036 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXA4-201ENST00000360046 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB7AO95365 584 aa27■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 RTL9Q8NET4 1388 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 EYA2O00167 538 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 SASH1O94885 1247 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 SPEF2Q9C093 1822 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 LRRC24Q50LG9 513 aa26.96■■□□□ 1.91
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HOXA4-201ENST00000360046 CIAO1O76071 339 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXA4-201ENST00000360046 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO3Q9UK99 471 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 TFCP2Q12800 502 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 MTFR1LQ9H019 292 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 LRP5O75197 1615 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 TAF1P21675 1872 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 POLD1P28340 1107 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 AACSQ86V21 672 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 COL4A1P02462 1669 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXA4-201ENST00000360046 MX1P20591 662 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 METTL24Q5JXM2 366 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 PDE6BP35913 854 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 TNNI3KQ59H18 835 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 PDE1AP54750 535 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 CRY2Q49AN0 593 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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