RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KSR2Q6VAB6 950 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TCP10Q12799 353 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TNFAIP1Q13829 316 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 PLS1Q14651 629 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 MBIPQ9NS73 344 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CLRN2A0PK11 232 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TAF5LO75529 589 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3C2AO00443 1686 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 MKNK2Q9HBH9 465 aa5.39□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 HOOK2Q96ED9 719 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 NBR1Q14596 966 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TNS4Q8IZW8 715 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ITGA6P23229 1130 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 NACAP1Q9BZK3 213 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 BCAR3O75815 825 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF521Q96K83 1311 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 GYS1P13807 737 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K12Q12852 859 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 LINS1Q8NG48 757 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L8P0C7I0 530 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CNGA1P29973 690 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CRBNQ96SW2 442 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 IL16Q14005 1332 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 COL15A1P39059 1388 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 GRM8O00222 908 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 HLFQ16534 295 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 FAM161AQ3B820 660 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 SUSD4Q5VX71 490 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TMC4Q7Z404 712 aa5.36□□□□□ -1.55
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