RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 SRGAP3O43295 1099 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 POLA2Q14181 598 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 SUCLG2Q96I99 432 aa22.36■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 RAB11FIP3O75154 756 aa22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 C1QTNF8P60827 252 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 NUCB1Q02818 461 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 SETDB2Q96T68 719 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.33■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.33■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SYNE4-201ENST00000324444 MYH3P11055 1940 aa22.33■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 NTSR2O95665 410 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 SUSD4Q5VX71 490 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 KAZALD1Q96I82 304 aa22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 H0YIN7 160 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 NPHP1O15259 732 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 NYXQ9GZU5 481 aa22.3■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 CNBD1Q8NA66 436 aa22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.29■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 TTLL6Q8N841 843 aa22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.28■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 PDE6BP35913 854 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 ST5P78524 1137 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 FAM89AQ96GI7 184 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.27■■□□□ 1.16
SYNE4-201ENST00000324444 PDE8AO60658 829 aa22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 FOXO4P98177 505 aa22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.26■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 SYNE4Q8N205 404 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 FBXO3Q9UK99 471 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 ABCC12Q96J65 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 COPRSQ9NQ92 184 aa22.25■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 RGS3P49796 1198 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 LNPKQ9C0E8 428 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 RNF181Q9P0P0 153 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.24■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 CSF1RP07333 972 aa22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 RASSF7Q02833 373 aa22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.23■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 FAM177BA6PVY3 158 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.22■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 CTSWP56202 376 aa22.21■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 ERFEQ4G0M1 354 aa22.21■■□□□ 1.15
SYNE4-201ENST00000324444 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.2■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 SRGNP10124 158 aa22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 SBF1O95248 1867 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 KIF3CO14782 793 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 STYK1Q6J9G0 422 aa22.18■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 APBB1O00213 710 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 C21orf2O43822 256 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 CIAO1O76071 339 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 CNKSR1Q969H4 720 aa22.17■■□□□ 1.14
SYNE4-201ENST00000324444 RTL9Q8NET4 1388 aa22.17■■□□□ 1.14
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