RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 C4BP0C0L5 1744 aa19.99■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 MX1P20591 662 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC24Q50LG9 513 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 TTC22Q5TAA0 569 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 COPRSQ9NQ92 184 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 NARFQ9UHQ1 456 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 RFC4P35249 363 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 GREM2Q9H772 168 aa19.98■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 TFCP2Q12800 502 aa19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 TTLL11Q8NHH1 800 aa19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 SALL3Q9BXA9 1300 aa19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.97■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 AACSQ86V21 672 aa19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.96■□□□□ 0.79
CHTF18-202ENST00000317063 NTSR2O95665 410 aa19.95■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 SDSP20132 328 aa19.95■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 CSF1RP07333 972 aa19.95■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.95■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 CTSWP56202 376 aa19.94■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 ERFEQ4G0M1 354 aa19.94■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.94■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 ATG9AQ7Z3C6 839 aa19.94■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 CDHR2Q9BYE9 1310 aa19.94■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 ITGA6P23229 1130 aa19.94■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 PDE8AO60658 829 aa19.93■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 ERC1Q8IUD2 1116 aa19.93■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 PARP10Q53GL7 1025 aa19.93■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 PLA2G12BQ9BX93 195 aa19.93■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 BCORQ6W2J9 1755 aa19.93■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 SETDB2Q96T68 719 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF827Q17R98 1081 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 RILPL2Q969X0 211 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 SEC31BQ9NQW1 1179 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 MYH3P11055 1940 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 OSBPL3Q9H4L5 887 aa19.92■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 TIMM10P62072 90 aa19.91■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 NFKBIBQ15653 356 aa19.91■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.91■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.91■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 PLSCR1O15162 318 aa19.91■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 STAP2Q9UGK3 403 aa19.9■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 UBR3Q6ZT12 1888 aa19.9■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 C4AP0C0L4 1744 aa19.9■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 TAF1P21675 1872 aa19.9■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 EYA2O00167 538 aa19.9■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.89■□□□□ 0.78
CHTF18-202ENST00000317063 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 NEUROD6Q96NK8 337 aa19.89■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa19.89■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 NFIXQ14938 502 aa19.88■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 TNNI3KQ59H18 835 aa19.88■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa19.88■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa19.88■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa19.88■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.87■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 NPHP1O15259 732 aa19.87■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 SCN7AQ01118 1682 aa19.87■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 GYS1P13807 737 aa19.86■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19.86■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC12Q96J65 1359 aa19.86■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.86■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 CNNM1Q9NRU3 951 aa19.86■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 SNAP23O00161 211 aa19.85■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 CDC45O75419 566 aa19.85■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 DEFB132Q7Z7B7 95 aa19.85■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.84■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa19.84■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 COL4A1P02462 1669 aa19.84■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 SSFA2P28290 1259 aa19.83■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 TPTE2Q6XPS3 522 aa19.83■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 AKT1S1Q96B36 256 aa19.83■□□□□ 0.77
CHTF18-202ENST00000317063 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms