RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 C1QTNF8P60827 252 aa22.3■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.3■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 LMNB1P20700 586 aa22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 RASSF7Q02833 373 aa22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 ERFEQ4G0M1 354 aa22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 WWC1Q8IX03 1113 aa22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.29■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC12Q96J65 1359 aa22.28■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 NFKBIEO00221 500 aa22.28■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 NTSR2O95665 410 aa22.28■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 HYPKQ9NX55 129 aa22.28■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.27■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 CRY2Q49AN0 593 aa22.27■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 SOGA3Q5TF21 947 aa22.27■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.27■■□□□ 1.16
PLGRKT-201ENST00000223864 ALDH1B1P30837 517 aa22.26■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 PRELPP51888 382 aa22.26■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 TCIRG1Q13488 830 aa22.26■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.26■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.26■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.25■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.25■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.25■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 IL16Q14005 1332 aa22.25■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 LAMB2P55268 1798 aa22.25■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.24■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.24■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.23■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 NLRP10Q86W26 655 aa22.23■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 CACNA1FO60840 1977 aa22.23■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 KIF3CO14782 793 aa22.22■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.22■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.22■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.22■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC93Q567U6 631 aa22.21■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.21■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 NLRP3Q96P20 1036 aa22.21■■□□□ 1.15
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR63Q8IWG1 891 aa22.2■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 TSPYL6Q8N831 410 aa22.2■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.2■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 OTUD5Q96G74 571 aa22.19■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.19■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.19■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.18■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.18■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 GLTPD2A6NH11 291 aa22.16■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.16■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 OLFM4Q6UX06 510 aa22.16■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.16■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 TAF1P21675 1872 aa22.15■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.15■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 SYNE4Q8N205 404 aa22.15■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.14■■□□□ 1.14
PLGRKT-201ENST00000223864 TOMM70O94826 608 aa22.14■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 STK31Q9BXU1 1019 aa22.14■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.13■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 RRAGCQ9HB90 399 aa22.13■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 BOLA1Q9Y3E2 137 aa22.13■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 SNED1Q8TER0 1413 aa22.13■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 WDR90Q96KV7 1748 aa22.11■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF428Q96B54 188 aa22.11■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM89AQ96GI7 184 aa22.11■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 PSMD1Q99460 953 aa22.11■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 MICALL2Q8IY33 904 aa22.1■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 ABCC4O15439 1325 aa22.09■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 BBOX1O75936 387 aa22.09■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 MYD88Q99836 296 aa22.09■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 KSR2Q6VAB6 950 aa22.08■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PLGRKT-201ENST00000223864 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.6 ms