RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 FAM161AQ3B820 660 aa23.15■■□□□ 1.3
PRRT1-201ENST00000211413 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PRRT1-201ENST00000211413 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
PRRT1-201ENST00000211413 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.14■■□□□ 1.3
PRRT1-201ENST00000211413 SSH3Q8TE77 659 aa23.14■■□□□ 1.3
PRRT1-201ENST00000211413 SIL1Q9H173 461 aa23.14■■□□□ 1.3
PRRT1-201ENST00000211413 GREM2Q9H772 168 aa23.14■■□□□ 1.3
PRRT1-201ENST00000211413 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.14■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 PDE8AO60658 829 aa23.14■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 CTSWP56202 376 aa23.14■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 POLA2Q14181 598 aa23.14■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 CNBD1Q8NA66 436 aa23.14■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 MYH3P11055 1940 aa23.13■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 CASZ1Q86V15 1759 aa23.13■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 NYXQ9GZU5 481 aa23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 COL4A1P02462 1669 aa23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 MTX1Q13505 466 aa23.12■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 CSF1RP07333 972 aa23.11■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 LAMB2P55268 1798 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 DCTPP1Q9H773 170 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.1■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 SLC51AQ86UW1 340 aa23.09■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 HMMRO75330 724 aa23.08■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 ITGA6P23229 1130 aa23.08■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.08■■□□□ 1.29
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.07■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 SMC5Q8IY18 1101 aa23.07■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.07■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC24Q50LG9 513 aa23.06■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.06■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP3Q96P20 1036 aa23.06■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.05■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 ST5P78524 1137 aa23.05■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 LNPKQ9C0E8 428 aa23.05■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.04■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 SPEF2Q9C093 1822 aa23.03■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.03■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.03■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 SASH1O94885 1247 aa23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 GCC1Q96CN9 775 aa23.02■■□□□ 1.28
PRRT1-201ENST00000211413 COPRSQ9NQ92 184 aa23.01■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 RGS3P49796 1198 aa23■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 NUCB1Q02818 461 aa23■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 MTFR1LQ9H019 292 aa23■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 CHRNA5P30532 468 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 SNAP23O00161 211 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 TFCP2Q12800 502 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.98■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.97■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 EYA2O00167 538 aa22.96■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.96■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.96■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PRRT1-201ENST00000211413 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 CRY2Q49AN0 593 aa22.95■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 KLHL34Q8N239 644 aa22.95■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.95■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 TAF5LO75529 589 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 PTGER2P43116 358 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 SRGNP10124 158 aa22.93■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.93■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.93■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 CACNA1SQ13698 1873 aa22.92■■□□□ 1.26
PRRT1-201ENST00000211413 RAB11FIP3O75154 756 aa22.92■■□□□ 1.26
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