RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000071248.11

Agrn-201, Transcript of Agrin, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Agrn, Length 4,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agrn-201ENSMUST00000071248 Neurl4Q5NCX5 1563 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Tsg101Q61187 391 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Gm21985Q6P6P5 1106 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Zkscan8Q8BSL0 588 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Eno4Q8C042 619 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Nek11Q8C0Q4 628 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Rad50P70388 1312 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Cavin1O54724 392 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 HellsQ60848 821 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Hand2Q61039 217 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Cdca7Q9D0M2 382 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Snapc4Q8BP86 1333 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Uggt1Q6P5E4 1551 aa14.78□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Pard3Q99NH2 1333 aa14.77□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Triml1Q8BVP1 470 aa14.77□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Myl6bQ8CI43 207 aa14.77□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Agrn-201ENSMUST00000071248 Lrrfip2Q91WK0 415 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 FancaQ9JL70 1439 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Cetn1P41209 172 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Stat1P42225 749 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Kmt5bQ3U8K7 883 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Smtnl1Q99LM3 459 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Mroh2aD3Z750 1679 aa14.77□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Kif21bQ9QXL1 1668 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Sult6b1P0CC03 303 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 MpndQ3TV65 487 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 FanclQ9CR14 375 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Fam135bQ9DAI6 1403 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Phldb2Q8K1N2 1249 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 TnrQ8BYI9 1358 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 TsksO54887 585 aa14.76□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Col20a1Q923P0 1320 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Fam184aE9PW83 1143 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 RgmbQ7TQ33 436 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Dctn1O08788 1281 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Txndc16Q7TN22 820 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Gas2l3Q3UWW6 683 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Krt23Q99PS0 422 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 NhsB1AV60 1647 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Zbtb38Q3LR78 1197 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Pdcl3Q8BVF2 240 aa14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Fhod3Q76LL6 1578 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Cct2P80314 535 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Abtb2Q7TQI7 1024 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Abcc12Q80WJ6 1366 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Mast3Q3U214 1321 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Svs3aF2Z472 265 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Zcwpw1Q6IR42 630 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Tekt3Q6X6Z7 490 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Usp37Q8C0R0 979 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Tmem119Q8R138 280 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 CenppQ9CZ92 286 aa14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Fchsd1Q6PFY1 688 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Bcl11aQ9QYE3 773 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Tmem2Q5FWI3 1383 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 EvcP57680 1005 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Rps8P62242 208 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Brinp3Q499E0 766 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Pla2g4fQ50L41 855 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Abca8bQ8K440 1620 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 1700029H14RikE9PY36 240 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 TxlnbQ8VBT1 685 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Clip2Q9Z0H8 1047 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 TnksQ6PFX9 1320 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Abcd1P48410 736 aa14.73□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 P4ha1Q60715 534 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Nid2O88322 1403 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 MeiocA2AG06 965 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Pram1Q6BCL1 675 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Lmod1Q8BVA4 595 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Slc35g1Q8BY79 368 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 CenpqQ9CPQ5 267 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 NmiO35309 314 aa14.72□□□□□ -0.05
Agrn-201ENSMUST00000071248 Mmp8O70138 465 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.1 ms