RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Snai1Q02085 264 aa22.79■■□□□ 1.24
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttc14Q9CSP9 761 aa22.79■■□□□ 1.24
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm13023A2A8N2 498 aa22.78■■□□□ 1.24
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc4a1P04919 929 aa22.74■■□□□ 1.23
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa22.73■■□□□ 1.23
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp6v1dP57746 247 aa22.73■■□□□ 1.23
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa22.73■■□□□ 1.23
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plekho1Q9JIY0 408 aa22.73■■□□□ 1.23
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa22.72■■□□□ 1.23
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa22.71■■□□□ 1.23
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Erc1Q99MI1 1120 aa22.71■■□□□ 1.23
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc7Q9D541 371 aa22.71■■□□□ 1.23
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kcnq5Q9JK45 933 aa22.71■■□□□ 1.23
Ldb1-201ENSMUST00000026252 TnksQ6PFX9 1320 aa22.7■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stox1B2RQL2 990 aa22.7■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gjb2Q00977 226 aa22.7■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Filip1lQ6P6L0 1131 aa22.7■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa22.7■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rnf20Q5DTM8 973 aa22.69■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa22.69■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fam160b2Q80YR2 744 aa22.69■■□□□ 1.22
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp4r3bQ922R5 820 aa22.69■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pde8bE9Q4S1 865 aa22.68■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CltaO08585 235 aa22.68■■□□□ 1.22
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Antxr1Q9CZ52 562 aa22.68■■□□□ 1.22
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 GalcP54818 684 aa22.68■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NpeppsQ11011 920 aa22.68■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ift57Q8BXG3 429 aa22.68■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa22.67■■□□□ 1.22
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cypt2Q6P924 180 aa22.67■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sgsm2Q80U12 1005 aa22.67■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pde4bB1AWC9 736 aa22.66■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plekhf1Q3TB82 279 aa22.66■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Foxo3Q9WVH4 672 aa22.66■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccne2Q9Z238 404 aa22.66■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tti2Q8BGV4 512 aa22.65■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cchcr1Q8K2I2 770 aa22.65■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atf7Q8R0S1 413 aa22.65■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hmg20bQ9Z104 317 aa22.65■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sept1P42209 366 aa22.65■■□□□ 1.22
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ugt1a5B2RT14 529 aa22.64■■□□□ 1.21
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Speer4dL7N216 212 aa22.64■■□□□ 1.21
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