RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	LYZL6	O75951	148 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	AKR7A3	O95154	331 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ATE1	O95260	518 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SLC6A2	P23975	617 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SLC35A1	P78382	337 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	DMTN	Q08495	405 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	KLF10	Q13118	480 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PDK3	Q15120	406 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	OR7A5	Q15622	319 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876		Q6ZT83	130 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PIGX	Q8TBF5	258 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	MED4	Q9NPJ6	270 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SAR1A	Q9NR31	198 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	EMC3	Q9P0I2	261 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	CAD	P27708	2225 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876		A0A1B0GWA3	101 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876		A8MVM7	634 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	FXYD1	O00168	92 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	NPIPB7	O75200	414 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	OPN1SW	P03999	348 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	RAF1	P04049	648 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PPP3CB	P16298	524 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	IL32	P24001	234 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	DNASE1	P24855	282 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	MAP2K6	P52564	334 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SLC16A1	P53985	500 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SMYD1	Q8NB12	490 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	C10orf82	Q8WW14	230 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PIF1	Q9H611	641 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	FANCF	Q9NPI8	374 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ARMCX1	Q9P291	453 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.41	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	MRAS	O14807	208 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	TPST2	O60704	377 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	MFN2	O95140	757 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PLAU	P00749	431 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	GPI	P06744	558 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	CD53	P19397	219 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	COX5A	P20674	150 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PTN	P21246	168 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	GZMM	P51124	257 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	P2RY4	P51582	365 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	EGR4	Q05215	589 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	KEAP1	Q14145	624 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	P2RY6	Q15077	328 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	TAB1	Q15750	504 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ZNF607	Q96SK3	696 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	FOXC2	Q99958	501 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.4	□□□□□ -0.58
RPSA-208	ENST00000487876	USP22	Q9UPT9	525 aa		11.4	□□□□□ -0.58

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