RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000213813.1

Ccdc84-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc84, Length 2,675 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Cyp4a32A2A8T1 509 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Nkx2-6P43688 289 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 PitpnaP53810 271 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Kcnk6Q3TBV4 313 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Mansc4Q3UU94 337 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Ptpn18Q61152 453 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Gm5346Q7M766 736 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Creg2Q8BGC9 288 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Stfa2l1Q8BWM3 103 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Ubqln1Q8R317 582 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Wdr45Q91VM3 360 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Arfgap1Q9EPJ9 414 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Dnajb8Q9QYI7 227 aa14.91□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Olfr485A0A140LJF5 317 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Olfr730E9Q8M3 318 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Spsb2O88838 264 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 CtslP06797 334 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Crmp1P97427 572 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 DgkzQ80UP3 929 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Slc36a2Q8BHK3 478 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Ces2eQ8BK48 559 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Nyap2Q8BM65 682 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Hpf1Q8CFE2 346 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Hist1h2aaQ8CGP4 129 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Mrgprb3Q91ZC1 312 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 BniplQ99JU7 328 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Isyna1Q9JHU9 557 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Dapp1Q9QXT1 280 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 NfkbiaQ9Z1E3 314 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Chrna10B2RX82 447 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Gm3327F7C9A1 213 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Vmn2r69G3XA45 850 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Mid1O70583 680 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Cacng2O88602 323 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Creg1O88668 220 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Rfx3P48381 749 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Sox9Q04887 507 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Fads2p1Q0VAX3 487 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Mmp7Q10738 264 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Uap1l1Q3TW96 507 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Nkx6-3Q3UHX8 262 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Avl9Q80U56 649 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 JamlQ80UL9 379 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Csnk1g2Q8BVP5 415 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Klf11Q8K1S5 502 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 BphlQ8R164 291 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Olfr99Q8VFE4 305 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 EcdQ9CS74 641 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Mfsd2aQ9DA75 534 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Fbxw5Q9QXW2 573 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Spag17Q5S003 2320 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Crybg1A0A0G2JG52 2065 aa14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 AgmatA2AS89 358 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Tmem240B2RWJ3 173 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Gm1110F6Y113 635 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Zfp994J3QM38 661 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Prdx6O08709 224 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Papss2O88428 621 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Ntrk2P15209 821 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Bpifa1P97361 278 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Serpine2Q07235 397 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Diras2Q5PR73 199 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Endod1Q8C522 501 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Mettl21eQ8CDZ2 244 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Olfr1491Q8VEZ5 319 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 GhitmQ91VC9 346 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Pkmyt1Q9ESG9 490 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Mocs2Q9Z223 189 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Scgb2b3D2XZ38 112 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 GlsD3Z7P3 674 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Gm43720E0CXM8 267 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Vmn2r113E9PZA6 856 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Olfr655E9Q252 308 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Cer1O55233 272 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Entpd6Q3U0P5 455 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Klhl6Q6V595 619 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Nudt15Q8BG93 170 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Slc25a45Q8CFJ7 288 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Tmcc3Q8R310 477 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Ccm2lQ8VCC6 481 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Olfr1261Q8VFB0 306 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Prl8a1Q9DAV8 240 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Zfp945E9PYM8 794 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Olfr1360K9J6X0 313 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Prl4a1O35256 227 aa14.89□□□□□ -0.03
Ccdc84-202ENSMUST00000213813 Pmm1O35621 262 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.8 ms