Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Mid1O70583 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Mid1O70583 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Mid1O70583 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Mid1O70583 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Mid1O70583 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mid1O70583 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Mid1O70583 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Mid1O70583 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Mid1O70583 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Mid1O70583 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Mid1O70583 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Mid1O70583 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Mid1O70583 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Mid1O70583 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mid1O70583 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mid1O70583 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Mid1O70583 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Mid1O70583 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Mid1O70583 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Mid1O70583 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Mid1O70583 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Mid1O70583 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Mid1O70583 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mid1O70583 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Mid1O70583 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Mid1O70583 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mid1O70583 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Mid1O70583 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Mid1O70583 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Mid1O70583 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Mid1O70583 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Mid1O70583 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mid1O70583 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Mid1O70583 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Mid1O70583 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Mid1O70583 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mid1O70583 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mid1O70583 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mid1O70583 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mid1O70583 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mid1O70583 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mid1O70583 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mid1O70583 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mid1O70583 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Mid1O70583 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mid1O70583 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mid1O70583 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mid1O70583 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mid1O70583 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mid1O70583 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mid1O70583 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Mid1O70583 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mid1O70583 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mid1O70583 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mid1O70583 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mid1O70583 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mid1O70583 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mid1O70583 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Mid1O70583 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mid1O70583 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mid1O70583 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mid1O70583 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mid1O70583 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mid1O70583 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mid1O70583 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Mid1O70583 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mid1O70583 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mid1O70583 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mid1O70583 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mid1O70583 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mid1O70583 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mid1O70583 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mid1O70583 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mid1O70583 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mid1O70583 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mid1O70583 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mid1O70583 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mid1O70583 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mid1O70583 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mid1O70583 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mid1O70583 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mid1O70583 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Mid1O70583 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mid1O70583 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mid1O70583 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mid1O70583 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mid1O70583 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Mid1O70583 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mid1O70583 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mid1O70583 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mid1O70583 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mid1O70583 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mid1O70583 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mid1O70583 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mid1O70583 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Mid1O70583 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mid1O70583 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mid1O70583 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mid1O70583 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms