Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
H2-Eb2Q3UUV9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
H2-Eb2Q3UUV9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
H2-Eb2Q3UUV9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
H2-Eb2Q3UUV9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
H2-Eb2Q3UUV9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
H2-Eb2Q3UUV9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
H2-Eb2Q3UUV9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
H2-Eb2Q3UUV9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H2-Eb2Q3UUV9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
H2-Eb2Q3UUV9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
H2-Eb2Q3UUV9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
H2-Eb2Q3UUV9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H2-Eb2Q3UUV9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
H2-Eb2Q3UUV9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
H2-Eb2Q3UUV9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H2-Eb2Q3UUV9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
H2-Eb2Q3UUV9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
H2-Eb2Q3UUV9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
H2-Eb2Q3UUV9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H2-Eb2Q3UUV9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H2-Eb2Q3UUV9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H2-Eb2Q3UUV9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H2-Eb2Q3UUV9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H2-Eb2Q3UUV9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H2-Eb2Q3UUV9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H2-Eb2Q3UUV9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H2-Eb2Q3UUV9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
H2-Eb2Q3UUV9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H2-Eb2Q3UUV9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
H2-Eb2Q3UUV9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H2-Eb2Q3UUV9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H2-Eb2Q3UUV9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H2-Eb2Q3UUV9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H2-Eb2Q3UUV9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
H2-Eb2Q3UUV9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H2-Eb2Q3UUV9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H2-Eb2Q3UUV9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H2-Eb2Q3UUV9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H2-Eb2Q3UUV9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H2-Eb2Q3UUV9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H2-Eb2Q3UUV9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
H2-Eb2Q3UUV9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Eb2Q3UUV9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H2-Eb2Q3UUV9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
H2-Eb2Q3UUV9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
H2-Eb2Q3UUV9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
H2-Eb2Q3UUV9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
H2-Eb2Q3UUV9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
H2-Eb2Q3UUV9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H2-Eb2Q3UUV9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2-Eb2Q3UUV9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H2-Eb2Q3UUV9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H2-Eb2Q3UUV9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2-Eb2Q3UUV9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2-Eb2Q3UUV9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2-Eb2Q3UUV9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2-Eb2Q3UUV9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2-Eb2Q3UUV9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2-Eb2Q3UUV9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
H2-Eb2Q3UUV9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2-Eb2Q3UUV9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2-Eb2Q3UUV9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2-Eb2Q3UUV9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2-Eb2Q3UUV9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms