Protein–RNA interactions for Protein: P53810

Pitpna, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnaP53810 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PitpnaP53810 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PitpnaP53810 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PitpnaP53810 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PitpnaP53810 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PitpnaP53810 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PitpnaP53810 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PitpnaP53810 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PitpnaP53810 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PitpnaP53810 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PitpnaP53810 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PitpnaP53810 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PitpnaP53810 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PitpnaP53810 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PitpnaP53810 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PitpnaP53810 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PitpnaP53810 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PitpnaP53810 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PitpnaP53810 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PitpnaP53810 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PitpnaP53810 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PitpnaP53810 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PitpnaP53810 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PitpnaP53810 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PitpnaP53810 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PitpnaP53810 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PitpnaP53810 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PitpnaP53810 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PitpnaP53810 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PitpnaP53810 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PitpnaP53810 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PitpnaP53810 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PitpnaP53810 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PitpnaP53810 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PitpnaP53810 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PitpnaP53810 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PitpnaP53810 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PitpnaP53810 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PitpnaP53810 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PitpnaP53810 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PitpnaP53810 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PitpnaP53810 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PitpnaP53810 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PitpnaP53810 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PitpnaP53810 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PitpnaP53810 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PitpnaP53810 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PitpnaP53810 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PitpnaP53810 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PitpnaP53810 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PitpnaP53810 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PitpnaP53810 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PitpnaP53810 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PitpnaP53810 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PitpnaP53810 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PitpnaP53810 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PitpnaP53810 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PitpnaP53810 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PitpnaP53810 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PitpnaP53810 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PitpnaP53810 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PitpnaP53810 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PitpnaP53810 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PitpnaP53810 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PitpnaP53810 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PitpnaP53810 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PitpnaP53810 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PitpnaP53810 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PitpnaP53810 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PitpnaP53810 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PitpnaP53810 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PitpnaP53810 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PitpnaP53810 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PitpnaP53810 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PitpnaP53810 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PitpnaP53810 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PitpnaP53810 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PitpnaP53810 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PitpnaP53810 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PitpnaP53810 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PitpnaP53810 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PitpnaP53810 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PitpnaP53810 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PitpnaP53810 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PitpnaP53810 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PitpnaP53810 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PitpnaP53810 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PitpnaP53810 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PitpnaP53810 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PitpnaP53810 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PitpnaP53810 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PitpnaP53810 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PitpnaP53810 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PitpnaP53810 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PitpnaP53810 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PitpnaP53810 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PitpnaP53810 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PitpnaP53810 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PitpnaP53810 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PitpnaP53810 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms