Protein–RNA interactions for Protein: O35256

Prl4a1, Prolactin-4A1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl4a1O35256 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Prl4a1O35256 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Prl4a1O35256 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Prl4a1O35256 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Prl4a1O35256 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prl4a1O35256 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Prl4a1O35256 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Prl4a1O35256 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Prl4a1O35256 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Prl4a1O35256 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prl4a1O35256 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prl4a1O35256 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prl4a1O35256 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prl4a1O35256 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Prl4a1O35256 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Prl4a1O35256 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Prl4a1O35256 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prl4a1O35256 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prl4a1O35256 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prl4a1O35256 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prl4a1O35256 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prl4a1O35256 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prl4a1O35256 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prl4a1O35256 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prl4a1O35256 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prl4a1O35256 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prl4a1O35256 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prl4a1O35256 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prl4a1O35256 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prl4a1O35256 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Prl4a1O35256 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prl4a1O35256 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prl4a1O35256 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prl4a1O35256 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prl4a1O35256 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prl4a1O35256 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prl4a1O35256 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prl4a1O35256 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prl4a1O35256 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prl4a1O35256 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prl4a1O35256 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prl4a1O35256 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prl4a1O35256 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Prl4a1O35256 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prl4a1O35256 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prl4a1O35256 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Prl4a1O35256 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prl4a1O35256 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prl4a1O35256 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prl4a1O35256 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prl4a1O35256 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prl4a1O35256 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prl4a1O35256 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl4a1O35256 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prl4a1O35256 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prl4a1O35256 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prl4a1O35256 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prl4a1O35256 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prl4a1O35256 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prl4a1O35256 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prl4a1O35256 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prl4a1O35256 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prl4a1O35256 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prl4a1O35256 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prl4a1O35256 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prl4a1O35256 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prl4a1O35256 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prl4a1O35256 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prl4a1O35256 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Prl4a1O35256 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prl4a1O35256 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prl4a1O35256 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prl4a1O35256 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prl4a1O35256 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prl4a1O35256 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prl4a1O35256 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Prl4a1O35256 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prl4a1O35256 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prl4a1O35256 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prl4a1O35256 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prl4a1O35256 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prl4a1O35256 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prl4a1O35256 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Prl4a1O35256 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prl4a1O35256 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prl4a1O35256 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prl4a1O35256 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prl4a1O35256 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prl4a1O35256 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Prl4a1O35256 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prl4a1O35256 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prl4a1O35256 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prl4a1O35256 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prl4a1O35256 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prl4a1O35256 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prl4a1O35256 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prl4a1O35256 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prl4a1O35256 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prl4a1O35256 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prl4a1O35256 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332.2 ms