RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487210.5

PLCB1-208, Transcript of phospholipase C beta 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PLCB1, Length 4,781 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB1-208ENST00000487210 WDR92Q96MX6 357 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TAAR9Q96RI9 348 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ADAM19Q9H013 955 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ELP3Q9H9T3 547 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.6□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 CACNA1SQ13698 1873 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 GGT3PA6NGU5 568 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 OPN1SWP03999 348 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 MMP3P08254 477 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SELEP16581 610 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 OR10A3P58181 314 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TTLL4Q14679 1199 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ZNF699Q32M78 642 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 BTNL3Q6UXE8 466 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 FAM129CQ86XR2 697 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 OR1L6Q8NGR2 347 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 OTUB2Q96DC9 234 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 CALML5Q9NZT1 146 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 RHCGQ9UBD6 479 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 DKKL1Q9UK85 242 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 NOD1Q9Y239 953 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 DYRK1BQ9Y463 629 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 PGRMC2O15173 223 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 AHSA1O95433 338 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SNHG28P0DPA3 235 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 CD1DP15813 335 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TBPP20226 339 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 DLSTP36957 453 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 HTR6P50406 440 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 BTG2P78543 158 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 ABHD18Q0P651 414 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 HEPACAMQ14CZ8 416 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 SLC9A3R2Q15599 337 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 OR2T2Q6IF00 324 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 BAP18Q8IXM2 172 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 MMP21Q8N119 569 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 THEM6Q8WUY1 208 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TMEM143Q96AN5 459 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TAS2R5Q9NYW4 299 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 TVP23BQ9NYZ1 205 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.59□□□□□ -1.67
PLCB1-208ENST00000487210 J3KTA2 159 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 CLIC1O00299 241 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 SH3BGRLO75368 114 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 ABLIM3O94929 683 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 GOSR1O95249 250 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 MT-ND5P03915 603 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 C8GP07360 202 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 RAB6AP20340 208 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 AGTR1P30556 359 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 SULT1A1P50225 295 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 LINC00303Q3SY05 128 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 HBMQ6B0K9 141 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 RTL6Q6ICC9 239 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 CHST9Q7L1S5 443 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 NR2C2APQ86WQ0 139 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 BEST3Q8N1M1 668 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 POGLUT1Q8NBL1 392 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 CD300LFQ8TDQ1 290 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 RNF141Q8WVD5 230 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.59□□□□□ -1.68
PLCB1-208ENST00000487210 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.2 ms