RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	PDLIM1	O00151	329 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CFLAR	O15519	480 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0513	O60268	411 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	NPHS1	O60500	1241 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TFPI	P10646	304 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFBP5	P24593	272 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PGM1	P36871	562 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FABP6	P51161	128 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC16A1	P53985	500 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	DSCR9	P59020	149 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PDK3	Q15120	406 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB35	Q15286	201 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC103	Q8IW40	242 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM168A	Q92567	244 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MUS81	Q96NY9	551 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB6	Q9NWX5	421 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MID2	Q9UJV3	735 aa		10.47	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35F4	A4IF30	521 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN24	A6NM45	220 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	STX11	O75558	287 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PMS2P2	O95744	297 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QC	P02747	245 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	G6PD	P11413	515 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PGC	P20142	388 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPS1L1	P21108	318 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MATN1	P21941	496 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	RYK	P34925	604 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	EMB	Q6PCB8	327 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGX	Q8TBF5	258 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	OR51I1	Q9H343	314 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	MKS1	Q9NXB0	559 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		10.46	□□□□□ -0.73
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	VWC2L	B2RUY7	222 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	AP3D1	O14617	1153 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	AK1	P00568	194 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNA2	P20248	432 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	EFNA4	P52798	201 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	H3F3A	P84243	136 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	MST1L	Q2TV78	715 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	PGS1	Q32NB8	556 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CASP12	Q6UXS9	341 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	NATD1	Q8N6N6	113 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB8B	Q92930	207 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ZG16B	Q96DA0	208 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	DUXA	A6NLW8	204 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR171	O14626	319 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	DNPH1	O43598	174 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	LMX1B	O60663	402 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TTLL3-233	ENST00000602338	SCN2B	O60939	215 aa		10.44	□□□□□ -0.74

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