RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAP3K8	P41279	467 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC12A2	P55011	1212 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL13RA1	P78552	427 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DOK3	Q7L591	496 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR119	Q8TDV5	335 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR22	Q99680	433 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	EBPL	Q9BY08	206 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q9N2J8	555 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	MALT1	Q9UDY8	824 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF225	Q9UK10	706 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	PSME2	Q9UL46	239 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NIF3L1-206	ENST00000416651	RYR2	Q92736	4967 aa		7.4	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIN1P1	O15428	100 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	STMN1	P16949	149 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALDH3B1	P43353	468 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ASMT	P46597	345 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	FNTA	P49354	379 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DIO1	P49895	249 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAAA	Q02083	359 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MVK	Q03426	396 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	BAMBI	Q13145	260 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC29A2	Q14542	456 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRP11	Q86VZ4	500 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2L13	Q8N349	312 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NANP	Q8TBE9	248 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR151	Q8TDV0	419 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERP27	Q96DN0	273 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ELP4	Q96EB1	424 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	APIP	Q96GX9	242 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CITED1	Q99966	193 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM5	Q9C035	493 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIN1	Q9NXP7	522 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SENP1	Q9P0U3	644 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	MID2	Q9UJV3	735 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	UGDH	O60701	494 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	RP2	O75695	350 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNK2	O95069	426 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NKX2-2	O95096	273 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NUDT14	O95848	222 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPANK1	O95872	356 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GFAP	P14136	432 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ELK4	P28324	431 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC7A1	P30825	629 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SSTR1	P30872	391 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	KHK	P50053	298 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	HTR6	P50406	440 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	SCGB2A2	Q13296	93 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUSP5	Q16690	384 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINGO2	Q7L985	606 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIMAP5	Q96F15	307 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	ARL5B	Q96KC2	179 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR78	Q96P69	363 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	BBS4	Q96RK4	519 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	RBBP8	Q99708	897 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAT9	Q9BTE0	207 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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