RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 KRT36O76013 467 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 IFNW1P05000 195 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ZNF136P52737 540 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 NPTX1Q15818 432 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 LDAHQ9H6V9 325 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 YY1AP1Q9H869 796 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ACKR4Q9NPB9 350 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CHST11Q9NPF2 352 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 NDUFAF4Q9P032 175 aa16.53■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 OIP5O43482 229 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 MGRN1O60291 552 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SNX4O95219 450 aa16.53■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF117Q03924 483 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 NDUFAF6Q330K2 333 aa16.53■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF550Q7Z398 422 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 DUSP19Q8WTR2 217 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 SDCCAG3Q96C92 435 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 UBQLN3Q9H347 655 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ICAM5Q9UMF0 924 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 CARD8Q9Y2G2 431 aa16.53■□□□□ 0.24
PTX4-201ENST00000293922 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.53■□□□□ 0.24
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PTX4-201ENST00000293922 C17orf51A8MQB3 221 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 C19orf84I3L1E1 186 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 HCRTR2O43614 444 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TPST2O60704 377 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FMO6PO60774 539 aa16.52■□□□□ 0.23
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PTX4-201ENST00000293922 MT-ND1P03886 318 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PRG2P13727 222 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ITGA2P17301 1181 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
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PTX4-201ENST00000293922 NEIL3Q8TAT5 605 aa16.52■□□□□ 0.23
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PTX4-201ENST00000293922 SLC6A15Q9H2J7 730 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ACAD8Q9UKU7 415 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FAM215AQ9Y5M1 114 aa16.52■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 NCKAP5O14513 1909 aa16.52■□□□□ 0.23
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PTX4-201ENST00000293922 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 hCG_2039718K7EN88 272 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 GKN3PP0CG01 181 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ACVR2AP27037 513 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 GDF1P27539 372 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 SLC6A8P48029 635 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PMPCAQ10713 525 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 EPS8Q12929 822 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 RTL6Q6ICC9 239 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 ZNF585AQ6P3V2 769 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PACS2Q86VP3 889 aa16.51■□□□□ 0.23
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PTX4-201ENST00000293922 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 RNF6Q9Y252 685 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 PKDREJQ9NTG1 2253 aa16.51■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 C2orf72A6NCS6 295 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 B4DXG7 233 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FAAHO00519 579 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 AP3D1O14617 1153 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 SNPHO15079 494 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 TIPRLO75663 272 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 CYP7B1O75881 506 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 FCGR1AP12314 374 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 RHCEP18577 417 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 MSX1P28360 303 aa16.5■□□□□ 0.23
PTX4-201ENST00000293922 MASP1P48740 699 aa16.5■□□□□ 0.23
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