RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 VWA2Q5GFL6 755 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 KIRREL2Q6UWL6 708 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 LNX2Q8N448 690 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.54□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.54□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.54□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 FN3KQ9H479 309 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 LNP1A1A4G5 178 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 FRG2CA6NGY1 282 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 A8MUA0 341 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 LRP3O75074 770 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SLC2A10O95528 541 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 NGFRP08138 427 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SYPP08247 313 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 HTR1FP30939 366 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF846Q147U1 533 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 NR0B2Q15466 257 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 DPYSL5Q9BPU6 564 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 MMP27Q9H306 513 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 HMG20AQ9NP66 347 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 METTL15A6NJ78 407 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 HCN1O60741 890 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 IDUAP35475 653 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 SOX3P41225 446 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 GPR143P51810 404 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 WNT4P56705 351 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF7P61962 342 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 CSRP2Q16527 193 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 HLA-BQ31612 363 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF404Q494X3 552 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 GUSBP11Q6P575 273 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 AMER2Q8N7J2 671 aa7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 ART5Q96L15 291 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 JAM3Q9BX67 310 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 CMC2Q9NRP2 79 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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PDE4D-208ENST00000502484 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-208ENST00000502484 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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