RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488137.5

C1orf109-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 109, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf109, Length 717 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109-208ENST00000488137 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF559Q9BR84 538 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 A4GALTQ9NPC4 353 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 FANCFQ9NPI8 374 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 GLRX2Q9NS18 164 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 IFT52Q9Y366 437 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.87□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SYT5O00445 386 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 MSTNO14793 375 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CXCL13O43927 109 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 DNAJA2O60884 412 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 THBS1P07996 1170 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 BMP2P12643 396 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CPOXP36551 454 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CARD18P57730 90 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SESN3P58005 492 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 COPZ1P61923 177 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SIRPAP78324 504 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 FOXF2Q12947 444 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 RNF220Q5VTB9 566 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 HMGN2P46Q86SG4 172 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 LUZP2Q86TE4 346 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 KRT73Q86Y46 540 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 OR52P1PQ8NH57 321 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SLC38A5Q8WUX1 472 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ADGRG7Q96K78 797 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ACER3Q9NUN7 267 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.86□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 A0A0J9YW62 118 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CFAP73A6NFT4 308 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TNFSF13O75888 250 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 NTN1O95631 604 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 C1QCP02747 245 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 OPN1LWP04000 364 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TFPTP0C1Z6 253 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 KIR2DL3P43628 341 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TLE4Q04727 773 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 NFYCQ13952 458 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 MMEL1Q495T6 779 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SYT14P1Q58G82 188 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF550Q7Z398 422 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 OSTF1Q92882 214 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 OR5B2Q96R09 309 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 NPAS1Q99742 590 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 KLHDC3Q9BQ90 382 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF385DQ9H6B1 395 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 JKAMPQ9P055 326 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 VAPAQ9P0L0 249 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CHRNA9Q9UGM1 479 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 PROCRQ9UNN8 238 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ANGPT4Q9Y264 503 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 GMEB1Q9Y692 573 aa11.85□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CDHR4A6H8M9 788 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CLDN24A6NM45 220 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CYSRT1A8MQ03 144 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 BBIP1A8MTZ0 92 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 FAAHO00519 579 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 AQP8O94778 261 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TFPIP10646 304 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CD8BP10966 210 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ETS2P15036 469 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 SLC6A2P23975 617 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 KCNJ5P48544 419 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 MAP2K6P52564 334 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 CYP51A1Q16850 503 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 ZNF311Q5JNZ3 666 aa11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
C1orf109-208ENST00000488137 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms