RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 SLC7A7Q9UM01 511 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 AUP1Q9Y679 476 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 CITO14578 2027 aa4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
TRDN-204ENST00000542443 GBF1Q92538 1859 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 A0A075B6Q4 140 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 FAM149AA5PLN7 773 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NEMP2A6NFY4 417 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 B4GAT1O43505 415 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LMX1BO60663 402 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SEC22BO75396 215 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CDK14O94921 469 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SEMA3DO95025 777 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 KRT75O95678 551 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TSHBP01222 138 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 RETP07949 1114 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GOT1P17174 413 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ERCC2P18074 760 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PTAFRP25105 342 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 EPHA2P29317 976 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 YAP1P46937 504 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ASCL1P50553 236 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 HUNKP57058 714 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 HERVK_113P63132 956 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 RBP5P82980 135 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LIPEQ05469 1076 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ACSM1Q08AH1 577 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 DMPKQ09013 629 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GPR50Q13585 617 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 KIAA0040Q15053 153 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CYP51A1Q16850 503 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ZNF404Q494X3 552 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SYT14P1Q58G82 188 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 WDR38Q5JTN6 314 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 C6orf183Q5T699 404 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CES3Q6UWW8 571 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SMIM5Q71RC9 77 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ISCA2Q86U28 154 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ZFAND4Q86XD8 727 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GRHL3Q8TE85 626 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 CCDC107Q8WV48 283 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ROBO4Q8WZ75 1007 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 HSD17B8Q92506 261 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 PIK3R3Q92569 461 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SLC38A4Q969I6 547 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TMBIM1Q969X1 311 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TADA1Q96BN2 335 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 LGALS12Q96DT0 336 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MOCOSQ96EN8 888 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ZNF354BQ96LW1 612 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 FEVQ99581 238 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 OMDQ99983 421 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MARCH7Q9H992 704 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 NEU3Q9UQ49 428 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 BTRCQ9Y297 605 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 KLK4Q9Y5K2 254 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.52□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SCN1AP35498 2009 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SYCE1LA8MT33 242 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 M0R3G1 203 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 AZIN1O14977 448 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ANGPT2O15123 496 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 BET1O15155 118 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 INPP4BO15327 924 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 ANXA9O76027 345 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SCELO95171 688 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SEC24AO95486 1093 aa4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TRDN-204ENST00000542443 SEMG1P04279 462 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms