RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5AK3PQ8NH89 298 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARID1AO14497 2285 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJE1A6NN92 205 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF195O14628 629 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF4O43474 513 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFNA2O43921 213 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 G6PDP11413 515 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOAT1P35610 550 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTBQ06643 244 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BHLHB9Q6PI77 547 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF614Q8N883 585 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF128Q8TEB7 428 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR7D2Q96RA2 312 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTR6Q9GZN1 396 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR52Q9Y2T5 361 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTNAQ9Y4J8 743 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPB9F8W1W9 429 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TYROBPO43914 113 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HBA1P69905 142 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGS1Q32NB8 556 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFAF6Q330K2 333 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM201Q5SNT2 666 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMBQ6PCB8 327 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC9AQ6UXN8 241 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q71RC1 249 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WFDC8Q8IUA0 241 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5D16Q8NGK9 328 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR119Q8TDV5 335 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD3Q8WU67 409 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PERPQ96FX8 193 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRXN1Q9BYN0 137 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10A4Q9H209 315 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSCAMO60469 2012 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NID1P14543 1247 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCAP17252 672 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ETV4P43268 484 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR1H2P55055 460 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN8P56748 225 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C21orf58P58505 322 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMX2Q04743 252 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS57Q6UWY2 283 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5W2Q8NH69 310 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRGPRX4Q96LA9 322 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q96MF0 132 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDF2Q99470 211 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASIC5Q9NY37 505 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL13Q9P2N7 655 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEATR5AQ86XA9 2040 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUXAA6NLW8 204 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM171A2A8MVW0 826 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF264O43296 627 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKD3O94806 890 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBL4AP11441 157 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MATN1P21941 496 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS26P62854 115 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMU1Q2TAY7 513 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCRLAQ7L513 359 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf120Q7Z4R8 191 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STEAP2Q8NFT2 490 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP90Q8TF47 636 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLPPR2Q96GM1 343 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZIM3Q96PE6 472 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GP6Q9HCN6 339 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROS1P08922 2347 aa23.33■■□□□ 1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITM2AO43736 263 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTN1O95631 604 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC7A1P30825 629 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCR4P51679 360 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELENBP1Q13228 472 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBFBQ13951 182 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A53Q5H9E4 307 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDZK1Q5T2W1 519 aa23.32■■□□□ 1.32
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