RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM216Q9P0N5 145 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 VDAC3Q9Y277 283 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 TNFSF11O14788 317 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 COQ9O75208 318 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 SUPT7LO94864 414 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 COL6A2P12110 1019 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 PPP3CBP16298 524 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 DDCP20711 480 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 VAMP1P23763 118 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GCAP28676 217 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 AGTR1P30556 359 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 MPIP34949 423 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ACVR1BP36896 505 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 CDKN1AP38936 164 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 MAP3K8P41279 467 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 PRR5P85299 388 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ACSM2AQ08AH3 577 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 C2orf80Q0P641 193 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 VEZF1Q14119 521 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 FGFBP1Q14512 234 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 RASA2Q15283 850 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 SGCBQ16585 318 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ACSM2BQ68CK6 577 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 OR2L13Q8N349 312 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GATSQ8NAP1 163 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 OR4C3Q8NH37 302 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 METTL6Q8TCB7 284 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 PIK3R3Q92569 461 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 SLC9A6Q92581 669 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 S100PBPQ96BU1 408 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF524Q96C55 264 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ELP4Q96EB1 424 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 DTNBP1Q96EV8 351 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ZIM3Q96PE6 472 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 BBS4Q96RK4 519 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF382Q96SR6 550 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 CENPHQ9H3R5 247 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ABCA1O95477 2261 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 A0A096LNT2 108 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PRB8 838 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 RNF212BA8MTL3 300 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ADAMDEC1O15204 470 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 EFNA2O43921 213 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 TMCC2O75069 709 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ULK1O75385 1050 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 CD8AP01732 235 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV4-39P01824 125 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 KRT6AP02538 564 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 KRT6BP04259 564 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 INHBAP08476 426 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ACP2P11117 423 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 FCGR2AP12318 317 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 EDNRAP25101 427 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 ECHS1P30084 290 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 HMOX2P30519 316 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 GABRA3P34903 492 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 KRT6CP48668 564 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 CTBP2P56545 445 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 PSPHP78330 225 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXD8-202ENST00000429017 DECR1Q16698 335 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms