RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SCML2Q9UQR0 700 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ABCC1P33527 1531 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FMN1Q68DA7 1419 aa5.08□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ITSN2Q9NZM3 1697 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CAVIN2O95810 425 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TGM6O95932 706 aa5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 MARK3P27448 753 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CD1CP29017 333 aa5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 CRYBA2P53672 197 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.64e-7■■■□□ 16.4
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MDM2-201ENST00000258148 RAB11BQ15907 218 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 SCYL2Q6P3W7 929 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 LINC00523Q86TU6 105 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 CATSPERDQ86XM0 798 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 MITD1Q8WV92 249 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 TADA1Q96BN2 335 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 MBOAT4Q96T53 435 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.07□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SNED1Q8TER0 1413 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 FANCAO15360 1455 aa5.07□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.06□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.06□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 PEX3P56589 373 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 PAX5Q02548 391 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 KLRC3Q07444 240 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ASPHQ12797 758 aa5.06□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 EMC2Q15006 297 aa5.06□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.06□□□□□ -1.6
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MDM2-201ENST00000258148 MARCH1Q8TCQ1 289 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 C11orf52Q96A22 123 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.06□□□□□ -1.6
MDM2-201ENST00000258148 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.06□□□□□ -1.6
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