RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	OIP5	O43482	229 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CYP7B1	O75881	506 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	NGFR	P08138	427 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	GUSB	P08236	651 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ETS2	P15036	469 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ME2	P23368	584 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	HTR1E	P28566	365 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CRYBA2	P53672	197 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TEX19	Q8NA77	164 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF138	Q8WVD3	245 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TAMM41	Q96BW9	452 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	MED12	Q93074	2177 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SPTA1	P02549	2419 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A1W2PQD3	144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153		B4DXG7	233 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TPST1	O60507	370 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	GGT1	P19440	569 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	KDELR2	P33947	212 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	KCNJ10	P78508	379 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SNTA1	Q13424	505 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	GNRHR2	Q96P88	292 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	MED11	Q9P086	117 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	KALRN	O60229	2985 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153		H3BNH8	94 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ARPC2	O15144	300 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SERPINB7	O75635	380 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	PDE9A	O76083	593 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	MFN2	O95140	757 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CSTA	P01040	98 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	NID1	P14543	1247 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	MS4A2	Q01362	244 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	PLAUR	Q03405	335 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF117	Q03924	483 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	DUSP7	Q16829	419 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CCDC80	Q76M96	950 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ASRGL1	Q7L266	308 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	DSN1	Q9H410	356 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	IFT52	Q9Y366	437 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	FAM166B	A8MTA8	275 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	FRS3	O43559	492 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SUMO3-206	ENST00000479153	HCRTR2	O43614	444 aa		11.96	□□□□□ -0.49

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