RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 LILRB5O75023 590 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 DNAJB6O75190 326 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 OXA1LQ15070 435 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 AGERQ15109 404 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 OR1Q1Q15612 314 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 UBE3DQ7Z6J8 389 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 OPALINQ96PE5 141 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 ALG8Q9BVK2 526 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 KCNN2Q9H2S1 579 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 AKIP1Q9NQ31 210 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 TAS2R7Q9NYW3 318 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN4-201ENST00000272638 AQP9O43315 295 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FGF17O60258 216 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PDE7AQ13946 482 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 NFATC4Q14934 902 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 OR5M10Q6IEU7 315 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LINGO2Q7L985 606 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TIGD4Q8IY51 512 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PROKR2Q8NFJ6 384 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF566Q969W8 418 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FN3KQ9H479 309 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CPED1A4D0V7 1026 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SULT1C4O75897 302 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LGI1O95970 557 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 RCVRNP35243 200 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 OR1D4P47884 311 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 RAB15P59190 212 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LGALS3BPQ08380 585 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 DUSP6Q16828 381 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PHC2Q8IXK0 858 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00471Q8N535 108 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM163Q8TC26 289 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 A4GNTQ9UNA3 340 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TSPAN11A1L157 253 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SOBPA7XYQ1 873 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 COL9A1P20849 921 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TPMTP51580 245 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 OR12D2P58182 307 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 RUNX2Q13950 521 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PON3Q15166 354 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 KCNJ8Q15842 424 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ARL14Q8N4G2 192 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 THEM6Q8WUY1 208 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 FRMD6Q96NE9 622 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 SCO2O43819 266 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CTSVO60911 334 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 IL7P13232 177 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CAPZA2P47755 286 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PGGHGQ32M88 737 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 C11orf88Q6PI97 169 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 NKD1Q969G9 470 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MSLNLQ96KJ4 702 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 GPA33Q99795 319 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 NEURL2Q9BR09 285 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 NRSN2Q9GZP1 204 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CHST8Q9H2A9 424 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 MUTYHQ9UIF7 546 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 HCRTR2O43614 444 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 PAHP00439 452 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CLUP10909 449 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 TGFBR2P37173 567 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 EOGTQ5NDL2 527 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN4-201ENST00000272638 HHATLQ9HCP6 504 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137 ms