RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		11.52	□□□□□ -0.56
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A0G2JPF8	293 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		G3V3Y1	287 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CXCR6	O00574	342 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OPN1SW	P03999	348 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NCK1	P16333	377 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CD247	P20963	164 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KRT20	P35900	424 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CASR	P41180	1078 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CASP3	P42574	277 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ATP12A	P54707	1039 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KCNJ2	P63252	427 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ARG2	P78540	354 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MS4A2	Q01362	244 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RHD	Q02161	417 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DMTN	Q08495	405 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GNA13	Q14344	377 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		Q6ZS92	163 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1W2PQD3	144 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TP53I11	O14683	189 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ACOT8	O14734	319 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SCO2	O43819	266 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ADAM11	O75078	769 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MFN2	O95140	757 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	THBS1	P07996	1170 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NID1	P14543	1247 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PGM1	P36871	562 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RASSF2	P50749	326 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FOXO1	Q12778	655 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	BNIP2	Q12982	314 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SKP2	Q13309	424 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MARCH3	Q86UD3	253 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PMM1	Q92871	262 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	HS6ST1	O60243	411 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	TPST1	O60507	370 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SP1	P08047	785 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ME2	P23368	584 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PRKAR1B	P31321	381 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	KDELR2	P33947	212 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DNASE1L1	P49184	302 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR85	P60893	370 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF117	Q03924	483 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SNTA1	Q13424	505 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667		Q8NA96	180 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DNMT1-208	ENST00000586667	GATS	Q8NAP1	163 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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