RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 KRTCAP3Q53RY4 240 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 AP1ARQ63HQ0 302 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 SULF2Q8IWU5 870 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 HIPK4Q8NE63 616 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 PIK3R3Q92569 461 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 TMEM19Q96HH6 336 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 POMPQ9Y244 141 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 GXYLT2A0PJZ3 443 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ZG16O60844 167 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 OR6B1O95007 311 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 BCHEP06276 602 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 GUSBP08236 651 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 NR2F1P10589 423 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ZNF24P17028 368 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 SYPL1Q16563 259 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 REEP3Q6NUK4 255 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 BCL2L10Q9HD36 194 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 OR10H1Q9Y4A9 318 aa16.73■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa16.72■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 KCNK2O95069 426 aa16.72■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 POGLUT1Q8NBL1 392 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ASB15Q8WXK1 588 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 RUBCNLQ9H714 662 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 HPF1Q9NWY4 346 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 CALML5Q9NZT1 146 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ANGPT4Q9Y264 503 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ZNF835Q9Y2P0 537 aa16.72■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 C5orf58C9J3I9 102 aa16.71■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 GPR85P60893 370 aa16.71■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 GORASP2Q9H8Y8 452 aa16.71■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 POLE3Q9NRF9 147 aa16.71■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 DEPPQ9NTK1 212 aa16.71■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.71■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 A0A0G2JPF8 293 aa16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa16.7■□□□□ 0.26
PTX4-201ENST00000293922 STX11O75558 287 aa16.7■□□□□ 0.26
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