RNA–Protein interactions for RNA: YER067W

RGI1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RGI1, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGI1	YER067W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	CDA1	Q06702	301 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
RGI1	YER067W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
RGI1	YER067W	MCD4	P36051	919 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	YGR012W	P53206	393 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	PCL2	P25693	308 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	STE13	P33894	931 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	ALY2	P47029	1046 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	HXT16	P47185	567 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	GCV2	P49095	1034 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	HDA1	P53973	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	PLB2	Q03674	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	THI73	Q07904	523 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	NUP145	P49687	1317 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SFL1	P20134	766 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	RPC82	P32349	654 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SCT1	P32784	759 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	LRG1	P35688	1017 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	MND2	P40577	368 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	AIM14	P53109	570 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	MET13	P53128	600 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	ORC3	P54790	616 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SPE1	P08432	466 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	HSF1	P10961	833 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	HMG1	P12683	1054 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	ELM1	P32801	640 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SAP190	P36123	1033 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	CAF16	P43569	289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
RGI1	YER067W	YGR237C	P50089	785 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	GPG1	P53130	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	UME1	Q03010	460 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	CRR1	Q05790	422 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	REH1	Q06709	432 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	DFG16	Q99234	619 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	PRC1	P00729	532 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	MIH1	P23748	554 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	MGS1	P40151	587 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	PUS2	P53167	370 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RGI1	YER067W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	HOG1	P32485	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	SHR5	P41912	237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	YGL081W	P53156	320 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	VPS30	Q02948	557 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	SGD1	Q06132	899 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	ATG33	Q06485	197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	TPO1	Q07824	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	DIF1	O13577	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	POA1	P38218	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	PMT3	P47190	753 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	EMC1	P25574	760 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	UBP5	P39944	805 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	YJR096W	P47137	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	YJR120W	P47157	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	ENV11	P53246	860 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	SNO2	P53823	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	MRPL22	P53881	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	GUD1	Q07729	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	GUP2	Q08929	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	YKR051W	P36142	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	LAM1	P38851	1228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	YAP6	Q03935	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	NHX1	Q04121	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	ADY3	Q07732	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	SEG2	P34250	1132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RGI1	YER067W	MEF2	P39677	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 270 ms