RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614484.4

SRRT-215, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRT, Length 2,964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-215ENST00000614484 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.74□□□□□ -0.05
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SRRT-215ENST00000614484 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 HLFQ16534 295 aa14.73□□□□□ -0.05
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SRRT-215ENST00000614484 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 AK7Q96M32 723 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 MYD88Q99836 296 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 BTAF1O14981 1849 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 MSL1Q68DK7 614 aa14.72□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.72□□□□□ -0.05
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SRRT-215ENST00000614484 ZNF827Q17R98 1081 aa14.71□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.71□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SRRT-215ENST00000614484 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.71□□□□□ -0.06
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SRRT-215ENST00000614484 SYNE4Q8N205 404 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 KIF16BQ96L93 1317 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 HYPKQ9NX55 129 aa14.7□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.69□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.68□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 SLC20A2Q08357 652 aa14.68□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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SRRT-215ENST00000614484 HOXB7P09629 217 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 PANK2Q9BZ23 570 aa14.67□□□□□ -0.06
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SRRT-215ENST00000614484 ADCY9O60503 1353 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.67□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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SRRT-215ENST00000614484 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 RFC4P35249 363 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 ANAPC15P60006 121 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 KSR2Q6VAB6 950 aa14.66□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 IGKV5-2P06315 115 aa14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 GPATCH11Q8N954 259 aa14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 FAM89AQ96GI7 184 aa14.65□□□□□ -0.06
SRRT-215ENST00000614484 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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SRRT-215ENST00000614484 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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SRRT-215ENST00000614484 ZPR1O75312 459 aa14.64□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.64□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 COL15A1P39059 1388 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 PLSCR1O15162 318 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.63□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
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SRRT-215ENST00000614484 BEND3Q5T5X7 828 aa14.62□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 CEP120Q8N960 986 aa14.62□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 A0A087WZG4 1122 aa14.61□□□□□ -0.07
SRRT-215ENST00000614484 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.61□□□□□ -0.07
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