RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K1Q13233 1512 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 SNRKQ9NRH2 765 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CUL5Q93034 780 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 HMGXB3Q12766 1538 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 SDSP20132 328 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CLCN1P35523 988 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 MICU3Q86XE3 530 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 NCOA7Q8NI08 942 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CALML4Q96GE6 196 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 MYZAPP0CAP1 466 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 GPTP24298 496 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 MNAT1P51948 309 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 AMPD3Q01432 767 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC102BQ68D86 513 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 NECAB1Q8N987 351 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 KANK3Q6NY19 840 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CTR9Q6PD62 1173 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CAVIN2O95810 425 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRL1O94910 1474 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.525e-7■■■■□ 21.9
PTPRM-211ENST00000580170 PIP4K2BP78356 416 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 KRT222Q8N1A0 295 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CUL7Q14999 1698 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 ANAPC15P60006 121 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 GNG11P61952 73 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 KIF5BP33176 963 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRM-211ENST00000580170 USP48Q86UV5 1035 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 IDEP14735 1019 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 KAT14Q9H8E8 782 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 SPECC1Q5M775 1068 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 BRF1Q92994 677 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 SLF2Q8IX21 1173 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 JADE2Q9NQC1 790 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 CD109Q6YHK3 1445 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 SYKP43405 635 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 SCLT1Q96NL6 688 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 MEIS3Q99687 375 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 FOXO3O43524 673 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 TSPY2A6NKD2 308 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 UBA7P41226 1012 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 UBASH3AP57075 661 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 PDE1AP54750 535 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 PDE4BQ07343 736 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms