RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TBCD-223	ENST00000576691	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TBCD-223	ENST00000576691	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TBCD-223	ENST00000576691	NLRP10	Q86W26	655 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TBCD-223	ENST00000576691	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TBCD-223	ENST00000576691	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		21.21	■□□□□ 0.99
TBCD-223	ENST00000576691	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	21.2	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		21.2	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	GPT	P24298	496 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	NFIX	Q14938	502 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	NYX	Q9GZU5	481 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	MTFR1L	Q9H019	292 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	COG6	Q9Y2V7	657 aa		21.19	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	AAMP	Q13685	434 aa		21.18	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		21.18	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	21.18	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	21.18	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691		H7C1W4	665 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	GRM8	O00222	908 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	GNAI3	P08754	354 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	USP44	Q9H0E7	712 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	UTY	O14607	1347 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		21.17	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	NEFL	P07196	543 aa		21.16	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	SUSD4	Q5VX71	490 aa		21.16	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	21.16	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		21.15	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		21.15	■□□□□ 0.98
TBCD-223	ENST00000576691	SYT17	Q9BSW7	474 aa		21.14	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		21.13	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	21.13	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	NTSR2	O95665	410 aa		21.13	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	SERPINB2	P05120	415 aa		21.13	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	MMP10	P09238	476 aa		21.13	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	CRBN	Q96SW2	442 aa		21.13	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	UTRN	P46939	3433 aa		21.13	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		21.12	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		21.12	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	MSL1	Q68DK7	614 aa		21.12	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		21.12	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	21.11	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	CASP7	P55210	303 aa		21.11	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	DDR1	Q08345	913 aa		21.11	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		21.11	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	FAM89A	Q96GI7	184 aa		21.11	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	MEIS3	Q99687	375 aa		21.11	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	GNAI2	P04899	355 aa		21.1	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	POLD1	P28340	1107 aa		21.1	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	CNBD1	Q8NA66	436 aa		21.1	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	21.09	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	FAM177B	A6PVY3	158 aa		21.09	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	NPHP1	O15259	732 aa		21.09	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		21.09	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		21.09	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	21.08	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	ST5	P78524	1137 aa		21.08	■□□□□ 0.97
TBCD-223	ENST00000576691	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	21.07	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	ERFE	Q4G0M1	354 aa		21.07	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		21.07	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		21.07	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	PDE8A	O60658	829 aa		21.06	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		21.06	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	SYNE4	Q8N205	404 aa		21.05	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		21.05	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		21.04	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	KLHL34	Q8N239	644 aa		21.04	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	KAZALD1	Q96I82	304 aa		21.04	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	SUCLG2	Q96I99	432 aa		21.04	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	NLRP3	Q96P20	1036 aa		21.04	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		21.04	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	CSF1R	P07333	972 aa		21.03	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	FOXO4	P98177	505 aa		21.03	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		21.03	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	21.02	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	PDE6B	P35913	854 aa		21.02	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	21.02	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	21.02	■□□□□ 0.96
TBCD-223	ENST00000576691	CTSW	P56202	376 aa		21.01	■□□□□ 0.95
TBCD-223	ENST00000576691	MTX1	Q13505	466 aa		21.01	■□□□□ 0.95
TBCD-223	ENST00000576691	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	21.01	■□□□□ 0.95
TBCD-223	ENST00000576691	ATP8B2	P98198	1209 aa		21	■□□□□ 0.95
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		21	■□□□□ 0.95
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	21	■□□□□ 0.95

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