RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 SSFA2P28290 1259 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 OCLNQ16625 522 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 RNF217Q8TC41 542 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 SLAIN2Q9P270 581 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.41□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 FOXO3O43524 673 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 TBCELQ5QJ74 424 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 SENP2Q9HC62 589 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 CABP1Q9NZU7 370 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 ABCC5O15440 1437 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF8-211ENST00000574728 A2MP01023 1474 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 C21orf2O43822 256 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 KIFC2Q96AC6 838 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 DACH1Q9UI36 760 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 USP3Q9Y6I4 520 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 MAN1A2O60476 641 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 MLECQ14165 292 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 TEAD4Q15561 434 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 MTMR7Q9Y216 660 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 SERTM1A2A2V5 107 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 KCNA1Q09470 495 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 C4orf17Q53FE4 359 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 WDR44Q5JSH3 913 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PTPRKQ15262 1439 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 NOS2P35228 1153 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PLA2G4AP47712 749 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 POU4F2Q12837 409 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 COL26A1Q96A83 441 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 DAPK1P53355 1430 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 EML1O00423 815 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 RHOQP17081 205 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 TRIM47Q96LD4 638 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PHKA2P46019 1235 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 POTEAQ6S8J7 498 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.34□□□□□ -1.23
PRPF8-211ENST00000574728 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ADGRL2O95490 1459 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 AIDAQ96BJ3 306 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 NCOA1Q15788 1441 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ZMYM3Q14202 1370 aa7.33□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 A0A1B0GTH6 734 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 SOBPA7XYQ1 873 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 LCE2BO14633 110 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 TSPY4P0CV99 314 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 TSPY10P0CW01 314 aa7.32□□□□□ -1.24
PRPF8-211ENST00000574728 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms