RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAOK3Q9H2K8 898 aa23■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUP98P52948 1817 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRY2Q49AN0 593 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALDH1B1P30837 517 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC93Q567U6 631 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 SOGA3Q5TF21 947 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 SYNE4Q8N205 404 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 NLRP3Q96P20 1036 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLX4Q8IY92 1834 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-207ENST00000572043 GOLGA2Q08379 1002 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 RRAGCQ9HB90 399 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC51AQ86UW1 340 aa22.94■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL16Q14005 1332 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM89AQ96GI7 184 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYD88Q99836 296 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 CACNA1SQ13698 1873 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 GLTPD2A6NH11 291 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDR63Q8IWG1 891 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-207ENST00000572043 STK31Q9BXU1 1019 aa22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCC4O15439 1325 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 SBF1O95248 1867 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOMM70O94826 608 aa22.88■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.87■■□□□ 1.25
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CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.86■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC4A2P04920 1241 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 G2E3Q7L622 706 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.85■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.83■■□□□ 1.25
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNED1Q8TER0 1413 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 VAMP4O75379 141 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 KSR2Q6VAB6 950 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSMD1Q99460 953 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.82■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSPA6P17066 643 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRAPQ13588 217 aa22.81■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-207ENST00000572043 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 BBOX1O75936 387 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-207ENST00000572043 IGKV5-2P06315 115 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 FLIIQ13045 1269 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 JDP2Q8WYK2 163 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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