RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.6■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 APLP1P51693 650 aa29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 MBIPQ9NS73 344 aa29.59■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 FSTL1Q12841 308 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC184Q52MB2 194 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 C3orf67Q6ZVT6 689 aa29.58■■■□□ 2.33
PPP4C-212ENST00000567828 POTECB2RU33 542 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 HOXB7P09629 217 aa29.57■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 SNED1Q8TER0 1413 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 TAF1P21675 1872 aa29.56■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF853P0CG23 659 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 SCN4AP35499 1836 aa29.55■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.54■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 SLC51AQ86UW1 340 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 NLRP10Q86W26 655 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 IFT57Q9NWB7 429 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 TCIRG1Q13488 830 aa29.52■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PPP4C-212ENST00000567828 GNAI1P63096 354 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 SYNE4Q8N205 404 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 NLRP3Q96P20 1036 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 CRAMP1Q96RY5 1269 aa29.51■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 HTRA3P83110 453 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF428Q96B54 188 aa29.5■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 IARSP41252 1262 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 SLC10A5Q5PT55 438 aa29.49■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF541Q9H0D2 1346 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 COL4A5P29400 1685 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 PSMD1Q99460 953 aa29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 HYPKQ9NX55 129 aa29.47■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.46■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC4O15439 1325 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4C-212ENST00000567828 SH3TC1Q8TE82 1336 aa29.45■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 POTEIP0CG38 1075 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 POTEJP0CG39 1038 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 FZD9O00144 591 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 MRS2Q9HD23 443 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC37AA6NMS7 1700 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 IQCA1LA6NCM1 817 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 ANP32CO43423 234 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 JDP2Q8WYK2 163 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4C-212ENST00000567828 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 FAM89AQ96GI7 184 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 GOLGA2Q08379 1002 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 RIC3Q7Z5B4 369 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 LARGE2Q8N3Y3 721 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 PCNTO95613 3336 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 CHADLQ6NUI6 762 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 TSPYL6Q8N831 410 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 LTBP1Q14766 1721 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 COL4A1P02462 1669 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC27Q2M243 656 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 WWC1Q8IX03 1113 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 KLRG1Q96E93 195 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 BBOX1O75936 387 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 GRAPQ13588 217 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 GPC2Q8N158 579 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 HACL1Q9UJ83 578 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4C-212ENST00000567828 PPIP5K2O43314 1243 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 EIF6P56537 245 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 AOC3Q16853 763 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-212ENST00000567828 SP8Q8IXZ3 490 aa29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 191.6 ms