RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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NPAS3-211ENST00000551634 ANKRD1Q15327 319 aa28.17■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.17■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 ELP1O95163 1332 aa28.17■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 ZMYND15Q9H091 742 aa28.16■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 CCDC192P0DO97 292 aa28.16■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 KCNJ4P48050 445 aa28.16■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 HSPA2P54652 639 aa28.15■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 KRT85P78386 507 aa28.15■■■□□ 2.1
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NPAS3-211ENST00000551634 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 GRM8O00222 908 aa28.15■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 RNF20Q5VTR2 975 aa28.15■■■□□ 2.1
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NPAS3-211ENST00000551634 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.15■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
NPAS3-211ENST00000551634 SLC27A2O14975 620 aa28.13■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.13■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 FAM227BQ96M60 508 aa28.12■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 SUCLG2Q96I99 432 aa28.12■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.11■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 KAZALD1Q96I82 304 aa28.11■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.1■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 TTC6Q86TZ1 520 aa28.1■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 MPNDQ8N594 471 aa28.1■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 MED23Q9ULK4 1368 aa28.09■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa28.09■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 PXDNQ92626 1479 aa28.08■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.08■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 MAP3K11Q16584 847 aa28.08■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 FAM200AQ8TCP9 573 aa28.08■■■□□ 2.09
NPAS3-211ENST00000551634 PSME1Q06323 249 aa28.08■■■□□ 2.09
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NPAS3-211ENST00000551634 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
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NPAS3-211ENST00000551634 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.02■■■□□ 2.08
NPAS3-211ENST00000551634 FERMT3Q86UX7 667 aa28.02■■■□□ 2.08
NPAS3-211ENST00000551634 MRVI1Q9Y6F6 885 aa28.02■■■□□ 2.08
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NPAS3-211ENST00000551634 SLIT3O75094 1523 aa28.01■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa28■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 IGKV5-2P06315 115 aa28■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 ESCO1Q5FWF5 840 aa28■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 TNMDQ9H2S6 317 aa28■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 TAF5LO75529 589 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.99■■■□□ 2.07
NPAS3-211ENST00000551634 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.99■■■□□ 2.07
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