RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	ABCC12	Q96J65	1359 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872		F6X3S4	739 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	PDE6B	P35913	854 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-215	ENST00000533872	LAMB2	P55268	1798 aa		31.2	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	BCAR3	O75815	825 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	DPEP1	P16444	411 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872		A0A0G2JLW4	131 aa		31.16	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	KCNA3	P22001	575 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	CHRNA5	P30532	468 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872		H0YIN7	160 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	GCKR	Q14397	625 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RPS2-215	ENST00000533872	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	ALDH1L1	O75891	902 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	CRY2	Q49AN0	593 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	SRGN	P10124	158 aa		31.1	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	NLRP3	Q96P20	1036 aa		31.1	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		31.09	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	PIM2	Q9P1W9	311 aa		31.09	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872		H7C1W4	665 aa		31.08	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	TRIM27	P14373	513 aa		31.08	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		31.08	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	MASTL	Q96GX5	879 aa		31.08	■■■□□ 2.57
RPS2-215	ENST00000533872	ABCC4	O15439	1325 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	NPR1	P16066	1061 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	STYK1	Q6J9G0	422 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		31.07	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		31.06	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.06	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	MYH3	P11055	1940 aa		31.05	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	CASP7	P55210	303 aa		31.05	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	GRM8	O00222	908 aa		31.04	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	31.04	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	CACNA1S	Q13698	1873 aa		31.04	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	TTLL6	Q8N841	843 aa		31.03	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	CNKSR1	Q969H4	720 aa		31.03	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		31.03	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	PDE8A	O60658	829 aa		31.02	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
RPS2-215	ENST00000533872	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	31.01	■■■□□ 2.55	not detected	■■■□□ 14.7
RPS2-215	ENST00000533872	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.01	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	BCS1L	Q9Y276	419 aa		31.01	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	UTY	O14607	1347 aa		31	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		31	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	GPR162	Q16538	588 aa		31	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	TNN	Q9UQP3	1299 aa		31	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	SLX4	Q8IY92	1834 aa		30.99	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	ALDH1B1	P30837	517 aa		30.99	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		30.98	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	CTSW	P56202	376 aa		30.96	■■■□□ 2.55
RPS2-215	ENST00000533872	USP44	Q9H0E7	712 aa		30.96	■■■□□ 2.55

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