RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 LTBP1Q14766 1721 aa21.66■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.65■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PACS1-208ENST00000529677 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.64■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.63■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.63■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.63■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 CACNA1FO60840 1977 aa21.62■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 ERBB4Q15303 1308 aa21.61■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.61■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.61■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 USP16Q9Y5T5 823 aa21.61■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.6■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.6■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.6■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.59■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.59■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.59■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.59■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PACS1-208ENST00000529677 STARD3NLO95772 234 aa21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.57■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 PDIA6Q15084 440 aa21.56■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.55■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 BCORQ6W2J9 1755 aa21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 PDE6BP35913 854 aa21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 CNTROBQ8N137 903 aa21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 TSKSQ9UJT2 592 aa21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.54■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 COL4A5P29400 1685 aa21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 NBPF26B4DH59 902 aa21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 SRGNP10124 158 aa21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 EPHX2P34913 555 aa21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 NBPF15Q8N660 670 aa21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.53■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 A1BGP04217 495 aa21.52■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 STK31Q9BXU1 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 HACL1Q9UJ83 578 aa21.52■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.52■■□□□ 1.04
PACS1-208ENST00000529677 STYK1Q6J9G0 422 aa21.51■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 OLFM4Q6UX06 510 aa21.51■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 SNED1Q8TER0 1413 aa21.51■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 PROSER3Q2NL68 480 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 NECTIN2Q92692 538 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 CNKSR1Q969H4 720 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 CAPNS2Q96L46 248 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 HYPKQ9NX55 129 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.5■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.49■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 SLC4A2P04920 1241 aa21.48■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 KIF16BQ96L93 1317 aa21.48■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 BCAR3O75815 825 aa21.47■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.47■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.47■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 FZD9O00144 591 aa21.46■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 ANXA1P04083 346 aa21.46■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 CST9Q5W186 159 aa21.46■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 MASTLQ96GX5 879 aa21.46■■□□□ 1.03
PACS1-208ENST00000529677 AOC2O75106 756 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 SOGA3Q5TF21 947 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 G2E3Q7L622 706 aa21.45■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 CAMTA2O94983 1202 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 MYL6BP14649 208 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 FLIIQ13045 1269 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 CCDC93Q567U6 631 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 CNBD1Q8NA66 436 aa21.44■■□□□ 1.02
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.44■■□□□ 1.02
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