RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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PTPRK-218ENST00000525459 ABCC4O15439 1325 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 ALDH1L1O75891 902 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 ST5P78524 1137 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRK-218ENST00000525459 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
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PTPRK-218ENST00000525459 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM27P14373 513 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRK-218ENST00000525459 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
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PTPRK-218ENST00000525459 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.7■■□□□ 1.38
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PTPRK-218ENST00000525459 IGKV5-2P06315 115 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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PTPRK-218ENST00000525459 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.68■■□□□ 1.38
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PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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PTPRK-218ENST00000525459 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.66■■□□□ 1.38
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PTPRK-218ENST00000525459 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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PTPRK-218ENST00000525459 PDE6BP35913 854 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 ABCC12Q96J65 1359 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 GRM8O00222 908 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 PDE3AQ14432 1141 aa23.61■■□□□ 1.37
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PTPRK-218ENST00000525459 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 TGFB2P61812 414 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 FAM89AQ96GI7 184 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 UTYO14607 1347 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRK-218ENST00000525459 H7C1W4 665 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRK-218ENST00000525459 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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PTPRK-218ENST00000525459 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 PDE8AO60658 829 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 TNNQ9UQP3 1299 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 GNAI3P08754 354 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 CASP7P55210 303 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 CRY2Q49AN0 593 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 H0YIN7 160 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 PLIN1O60240 522 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 USP44Q9H0E7 712 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 RLBP1P12271 317 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 SYT17Q9BSW7 474 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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PTPRK-218ENST00000525459 SYNE4Q8N205 404 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 PANK1Q8TE04 598 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 SRGNP10124 158 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 NPR1P16066 1061 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 MASTLQ96GX5 879 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 CTSWP56202 376 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 STYK1Q6J9G0 422 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 RTL9Q8NET4 1388 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 MEIS3Q99687 375 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRK-218ENST00000525459 SPEF2Q9C093 1822 aa23.48■■□□□ 1.35
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