RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP89Q96ST8 783 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHST12Q9NRB3 414 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.31□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 BRICD5Q6PL45 260 aa7.3□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.3□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC39A13Q96H72 371 aa7.3□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 SQSTM1Q13501 440 aa7.3□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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CSNK1G3-210ENST00000521364 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.3□□□□□ -1.24
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CSNK1G3-210ENST00000521364 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.29□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 NR1I2O75469 434 aa7.29□□□□□ -1.24
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CSNK1G3-210ENST00000521364 LRRC41Q15345 812 aa7.29□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 EDEM1Q92611 657 aa7.29□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 GINM1Q9NU53 330 aa7.29□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 A6NHS1 94 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 POTEMA6NI47 508 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 IRS1P35568 1242 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 POTEGQ6S5H5 508 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 HOMER1Q86YM7 354 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPATCH11Q8N954 259 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 EPHA4P54764 986 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 KCNK17Q96T54 332 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.28□□□□□ -1.24
CSNK1G3-210ENST00000521364 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMEM260Q9NX78 707 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIF4AO95239 1232 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDGFAP04085 211 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC4A3P48751 1232 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.27□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCNN1DP51172 638 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 APBA2Q99767 749 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAB15P59190 212 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ERFEQ4G0M1 354 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.26□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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CSNK1G3-210ENST00000521364 FEZ1Q99689 392 aa7.26□□□□□ -1.25
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CSNK1G3-210ENST00000521364 C16orf86Q6ZW13 317 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ABTB2Q8N961 1025 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 THAP11Q96EK4 314 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ST7Q9NRC1 585 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 TSPAN6O43657 245 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP17L7P0C7H9 530 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 USP5P45974 858 aa7.25□□□□□ -1.25
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CSNK1G3-210ENST00000521364 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.25□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALDH1L1O75891 902 aa7.24□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 NOS2P35228 1153 aa7.24□□□□□ -1.25
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CSNK1G3-210ENST00000521364 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.24□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.24□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.24□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.24□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 CNGA1P29973 690 aa7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 TMX1Q9H3N1 280 aa7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIF3BO15066 747 aa7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 BDNFP23560 247 aa7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 GDF10P55107 478 aa7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CSNK1G3-210ENST00000521364 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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