RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PDE4D-217ENST00000509355 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.73□□□□□ -0.85
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PDE4D-217ENST00000509355 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.72□□□□□ -0.85
PDE4D-217ENST00000509355 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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PDE4D-217ENST00000509355 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.72□□□□□ -0.85
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PDE4D-217ENST00000509355 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PDE4D-217ENST00000509355 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-217ENST00000509355 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PDE4D-217ENST00000509355 MYO19Q96H55 970 aa9.7□□□□□ -0.86
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PDE4D-217ENST00000509355 INPP5BP32019 993 aa9.67□□□□□ -0.86
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PDE4D-217ENST00000509355 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.64□□□□□ -0.87
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PDE4D-217ENST00000509355 NEUROD1Q13562 356 aa9.64□□□□□ -0.87
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PDE4D-217ENST00000509355 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-217ENST00000509355 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.63□□□□□ -0.87
PDE4D-217ENST00000509355 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.63□□□□□ -0.87
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-217ENST00000509355 COL26A1Q96A83 441 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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PDE4D-217ENST00000509355 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.59□□□□□ -0.87
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PDE4D-217ENST00000509355 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 96.1
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PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K6O95382 1288 aa9.58□□□□□ -0.88
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PDE4D-217ENST00000509355 IGFLR1Q9H665 355 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-217ENST00000509355 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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