RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 WWC1Q8IX03 1113 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 HYPKQ9NX55 129 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC93Q567U6 631 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 NLRP10Q86W26 655 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-211ENST00000493436 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 OLFM4Q6UX06 510 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 NLRP3Q96P20 1036 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 RRAGCQ9HB90 399 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 LAMB2P55268 1798 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 GLTPD2A6NH11 291 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPYL6Q8N831 410 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 IL16Q14005 1332 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 TOMM70O94826 608 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 SYNE4Q8N205 404 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA2Q08379 1002 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF428Q96B54 188 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4-211ENST00000493436 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 HSPA6P17066 643 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR63Q8IWG1 891 aa21.56■■□□□ 1.04
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SH3BP4-211ENST00000493436 WDR90Q96KV7 1748 aa21.55■■□□□ 1.04
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SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM89AQ96GI7 184 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PSMD1Q99460 953 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 STK31Q9BXU1 1019 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SNED1Q8TER0 1413 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC4O15439 1325 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 CACNA1FO60840 1977 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC51AQ86UW1 340 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 MYD88Q99836 296 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 POTECB2RU33 542 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 BBOX1O75936 387 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC4A2P04920 1241 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 FSTL1Q12841 308 aa21.49■■□□□ 1.03
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SH3BP4-211ENST00000493436 KSR2Q6VAB6 950 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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SH3BP4-211ENST00000493436 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 G2E3Q7L622 706 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 SP8Q8IXZ3 490 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 JDP2Q8WYK2 163 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 VAMP4O75379 141 aa21.47■■□□□ 1.03
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