RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		7.35	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNQ2	O43526	872 aa		7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	APBA3	O96018	575 aa		7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	NRAP	Q86VF7	1730 aa		7.34	□□□□□ -1.23
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP27B1	O15528	508 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	NEFM	P07197	916 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	NBR1	Q14596	966 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	NUCB1	Q02818	461 aa		7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	PKDCC	Q504Y2	493 aa		7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP10D	Q9P241	1426 aa		7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC6	O95255	1503 aa		7.32	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	DISP2	A7MBM2	1401 aa		7.31	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	PHKG2	P15735	406 aa		7.31	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	LGR6	Q9HBX8	967 aa		7.31	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	MEGF6	O75095	1541 aa		7.31	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		7.31	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	CABP4	P57796	275 aa		7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	OXER1	Q8TDS5	423 aa		7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	LNPK	Q9C0E8	428 aa		7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	NCAPD2	Q15021	1401 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730		F6X3S4	739 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNQ3	O43525	872 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	BAG6	P46379	1132 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	DCAF5	Q96JK2	942 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	MEIS3	Q99687	375 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K5	Q99683	1374 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		7.29	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNQ4	P56696	695 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	PIGB	Q92521	554 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	CACNA1F	O60840	1977 aa		7.28	□□□□□ -1.24
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PLSCR1	O15162	318 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	PROX2	Q3B8N5	592 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP85	Q6P2H3	762 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	NECTIN2	Q92692	538 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	DCTPP1	Q9H773	170 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	TNS2	Q63HR2	1409 aa		7.27	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		7.26	□□□□□ -1.25
C4BPB-208	ENST00000492730	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25

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